Santiago sudah memahami konsekuensi yang bakal kerajaannya terima sebagai akibat dari penolakannya itu yaitu konfrontasi melawan VOC.
Dia kemudian mengumpulkan semua pejabat kerajaan dan para pemuka masyarakat untuk bersiap melawan VOC.
“I kite mendiahi wuntuang ‘u seke, nusa kumbahang katumpaeng” (Kita harus menyiapkan pasukan perang, negeri kita jangan dimasuki musuh),” kata Raja Santiago yang melegenda, membakar semangat patriotisme rakyatnya.
VOC yang kecewa dan marah atas penolakan Sang Raja, mengirimkan pasukannya untuk menundukkan Kerajaan Manganitu.
Perang pun tak dapat terhindarkan dan berlangsung selama 4 bulan di laut maupun pesisir pantai. Banyak korban yang jatuh dari kedua belah pihak.
Strategi Raja Santiago adalah menempatkan adiknya Charles Diamanti untuk memimpin perlawanan di pesisir pantai.
